La rivista ci rivela che all'inizio del gioco Sam apprende che Anna Grimsdottir è in pericolo, e per questo decide di rientrare in Third Echelon per andare a cercarla. Sam scopre però che Third Echelon non è più la stessa, e quando va in missione riceve informazioni ed attrezzatura errate, mentre i responsabili dell'ente governativo non fanno che litigare tra loro riguardo alle procedure ed altri problemi burocratici. Quando Sam scopre che la minaccia ad Anna proviene dall'interno di Third Echelon, decide di mollare e e diventare un fuggitivo. Il gioco si svolgerà prevalentemente all'aperto e sotto la luce del sole, ma rimmarrà comunque uno stealth game dove nascondersi ricopre un ruolo primario.

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